中美倡議啟動(dòng)“地球生物基因組計(jì)劃”

　　在美國(guó)斯密森尼生物多樣性基因組學(xué)項(xiàng)目組與中國(guó)華大基因公司近日聯(lián)合主辦的生物基因組學(xué)會(huì)議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學(xué)戴維斯分校基因組學(xué)家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學(xué)家張國(guó)捷等組成的科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合倡議，全球科學(xué)家合作開啟另一項(xiàng)與人類基因組計(jì)劃（HGP）類似的項(xiàng)目——地球生物基因組計(jì)劃（EBP），對(duì)地球上所有真核生物進(jìn)行測(cè)序。

　　據(jù)《科學(xué)》雜志官網(wǎng)報(bào)道，EBP計(jì)劃大約兩年前第一次提出，將著重對(duì)包括所有植物、動(dòng)物和單細(xì)胞生物在內(nèi)的真核生物群體進(jìn)行測(cè)序。倡議團(tuán)隊(duì)估計(jì)，得益于測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步和成本下降，可能只需10年時(shí)間以及與HGP相當(dāng)?shù)馁M(fèi)用（約27億美元），就能完成對(duì)全部真核生物的測(cè)序。

　　現(xiàn)有EBP框架大約分三步完成：第一步，為9000個(gè)真核生物科中的每科選出一個(gè)代表進(jìn)行DNA測(cè)序，獲得的參考基因組要與人類基因組相當(dāng)或更好；第二步，對(duì)15萬(wàn)到20萬(wàn)個(gè)真核生物屬中每個(gè)屬選取一個(gè)物種測(cè)序，詳細(xì)程度不需達(dá)到第一步的標(biāo)準(zhǔn)；第三步，對(duì)150萬(wàn)個(gè)真核生物物種進(jìn)行粗略性測(cè)序。

　　項(xiàng)目倡議人員表示，EBP已經(jīng)取得良好開端，好幾個(gè)測(cè)序項(xiàng)目已經(jīng)啟動(dòng)，包括為1萬(wàn)種脊椎動(dòng)物進(jìn)行基因組測(cè)序的基因組10K項(xiàng)目、破譯5000種節(jié)肢動(dòng)物基因組的i5K項(xiàng)目、為1萬(wàn)多種禽類物種測(cè)序基因組的B10K項(xiàng)目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰(zhàn)斗機(jī)中的戰(zhàn)斗機(jī)’。”萊文說(shuō)。

　　在會(huì)議上，中國(guó)華大基因和英國(guó)韋爾科姆基金會(huì)桑格研究所等基因組學(xué)領(lǐng)頭企業(yè)，表明了積極參與的立場(chǎng)，但EBP項(xiàng)目目前仍面臨重大挑戰(zhàn)：一是因生物多樣性問(wèn)題，只有更多發(fā)展中國(guó)家參與并開展更加國(guó)際化的合作，該項(xiàng)目才能最終成型；二是制定高質(zhì)量測(cè)序和保存有機(jī)體樣本的標(biāo)準(zhǔn)，其中因現(xiàn)有博物館動(dòng)植物樣品的保存方式不符合要求，或需要大量的野外采集樣品，這可能耗費(fèi)很大成本。